O Programa de Pós-graduação em Engenharia Química – PPGEQ/UFU dispõe de auxílio financeiro advindo da CAPES – PROEX, Taxa de Bancada – FAPEMIG, recursos da Universidade Federal de Uberlândia – UFU e recursos de projetos de docentes do Programa para o desenvolvimento de pesquisa, bem como para o custeio das atividades relacionadas ao andamento do Programa.
O PPGEQ/UFU conta hoje com bolsas de mestrado e doutorado, provenientes de órgãos de fomento como CAPES, CNPq, FAPEMIG e, também, bolsas de projetos de parceria entre a universidade e empresas privadas.